Вторая часть культовой франшизы о динозаврах, снятая самим Стивеном Спилбергом, разворачивается спустя четыре года после катастрофы в Парке Юрского периода. Закрытый объект на острове Исла Сорна не стал могилой для древних рептилий: динозавры выжили, адаптировались к дикой природе и продолжают жить в изоляции, пока на их территорию не ступают люди с корыстными целями.
В начале 1980-х в крупных городах США — Сан-Франциско, Нью-Йорке, Лос-Анджелесе — медики начали фиксировать случаи внезапной смерти молодых мужчин, большинство из которых были гомосексуалами. Первоначально патологии списывали на редкие формы пневмонии или саркомы Капоши, не видя между ними общей причины и не придавая случаям особого значения.
События ленты разворачиваются в подземных туннелях и катакомбах Нью-Йорка 1980-х годов, где на протяжении долгого времени обитают группы бездомных, выживающих за счет остатков из городских канализаций и подвалов. Власти города игнорируют их существование до тех пор, пока в подземельях не начинают массово исчезать как представители маргинальных слоев, так и обычные горожане, выпадающие из поля...