Сюжет фильма разворачивается после того, как семнадцатилетняя Лили решает сбежать из дома, где её не понимают родители, и отправиться на встречу с парнем, с которым она познакомилась в соцсетях. По дороге у девушки разряжается телефон, и она останавливает проезжающий мимо автомобиль, прося у водителя помощи, чтобы позвонить своему знакомому.
Лето 1968 года в Западной Германии: по улицам городов идут студенческие протесты, разгорается сексуальная революция, молодые люди отказываются от консервативных норм, которые царили в обществе послевоенных лет. В этот период перемен 14-летний Вольфганг оказывается в очень сложной ситуации: ревнивый отчим, который не ладит с пасынком, использует любую возможность избавиться от него, и...
Действие разворачивается в альтернативном будущем, где после страшной эпидемии неизвестного вируса Великобритания погрузилась в хаос, а на её обломках пришел к власти жестокий тоталитарный режим под руководством властного канцлера. В стране введен комендантский час, простые люди лишены основных прав, а тайная полиция и сеть осведомителей следят за каждым шагом граждан, подавляя любые попытки...
После вспышки смертельного вируса в XXI веке человечество почти полностью исчезло: выжившие живут в единственном защищенном специальным куполом городе, где власть принадлежит узкой группе элиты, а обычные жители лишены большинства свобод и живут по строгим нормам, установленным правящей верхушкой. Главная героиня истории — Эон Флакс, бесстрашная и непредсказуемая агентка подпольной...