Фильм является прямым продолжением истории Алисы, которая вернулась из Страны Чудес, и действие разворачивается спустя несколько лет после этих событий. Уже взрослая героиня работает капитаном торгового корабля, но неожиданно получает известие, что Безумный Шляпник смертельно болен: его семью унесло в прошлое, и только Алиса может помочь вернуть их и спасти друга.
