Через тридцать шесть лет после событий первого фильма Тим Бёртон возвращает зрителей в странный, выдержанный в фирменной эстетике режиссёра мир загробной жизни и живых, которые случайно переплетаются. Главная героиня Лидия Дитц, уже повзрослевшая, возвращается в родной городок Уинтер-Ривер вместе с дочерью-подростком Астрид и мачехой Делией, чтобы разобраться с делами после смерти отца девочки.
Семь лет назад доктор Джон Дулиттл, прославленный врач-ветеринар, живший в викторианской Англии, потерял любимую жену. Горе сломало его: он отказался от общения с людьми, закрылся в своём поместье за высокими стенами, и его единственными собеседниками стали экзотические животные из его большой коллекции — он научился понимать их речь и заботиться о каждом, независимо от вида.
В мире 2045 года, который погружается в социальный и экологический кризис, подавляющее большинство людей проводит свободное время в виртуальной вселенной OASIS — масштабной онлайн-игре, созданной гениальным и эксцентричным разработчиком Джеймсом Холлидеем. После его смерти становится известно завещание: тот, кто первым найдет спрятанное в игре цифровое пасхальное яйцо, получит полный контроль...